جمعیت میکروبی ساکن در روده ما ترکیبی منحصر بفرد از انواع و مقادیر مختلف باکتری هاست. در واقع، ترکیب باکتریایی بدن ثابت نیست و در حال تغییر است که می تواند تحت تأثیر رژیم غذایی، عوامل محیطی، داروها و غیره قرار بگیرد. تحقیقات علمی در قالب پروژه MetaHit اروپا (۲۰۰۸-۲۰۱۲) توانسته است سه گروه اصلی میکروبیوتا یا انتروتایپ مختلف را شناسایی کند: گروه یک باکتروئید بالا، گروه دو باکتروئید پایین ولی پرووتلا بالا و گروه سه رومنوکوکوس بالا. گفته می شود تغذیه در دراز مدت روی این ترکیب میکروبی اثر میگذارد به طرزی که رزیم غذایی غربی شامل مقادیر بالای منابع پروتئینی و چربی حیوانی باعث ایجاد انتروتایپ یک (باکتروئید بالا) و رژیم غذایی حاوی مقادیر زیاد کربوهیدرات و فیبر، ایجاد کننده انتروتایپ دو (پرووتلا بالا) هستند.
